matematikk.net

Jeg ønsker å regne ut p-verdi for ulike terms mellom to biologiske datasett. Etter det jeg har forstått må jeg utføre en Fisher eksakt test, men vet ikke helt hvordan jeg skal gå frem.

For et term/begrep har vi at
Cluster frekvens: 4 av 71
Genom frekvens: 844 av 6338

Viss noen kan sette meg på rett spor hadde jeg blitt veldig takknemlig.

Ariane skrev:Jeg ønsker å regne ut p-verdi for ulike terms mellom to biologiske datasett. Etter det jeg har forstått må jeg utføre en Fisher eksakt test, men vet ikke helt hvordan jeg skal gå frem.
For et term/begrep har vi at
Cluster frekvens: 4 av 71
Genom frekvens: 844 av 6338
Viss noen kan sette meg på rett spor hadde jeg blitt veldig takknemlig.

er dette relatert til Fisher's Z transform,?

[tex]Z={1\over 2}\ln|(1+r)/(1-r)|[/tex]
der
r er korrelasjonskoeffisienten

Har prøvd meg litt frem på http://www.socscistatistics.com/tests/f ... ault2.aspx

Setter

Gruppe 1: Ja
Gruppe 2: Nei

Categori 1: Cluster
Categori 2: Genome

Det vil si

4, 844
67, 5494

Problemet er at jeg har titalls slike terms/posisjon/funksjoner som jeg skal se på. Viss jeg må ta alle manuelt kommer det til å ta lang tid. Det bør kunne gjøres med Excel eller SigmaPlot, men kommer til kort

..samt blir denne fremgangsmåten riktig?